MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 1974

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004349	ATT	2	6	628	633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376232
2	NC_004349	AGC	2	6	683	688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376232
3	NC_004349	ATG	2	6	762	767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376232
4	NC_004349	AAGG	2	8	818	825	50 %	0 %	50 %	0 %	24376232
5	NC_004349	GTG	2	6	883	888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376232
6	NC_004349	AGTA	2	8	908	915	50 %	25 %	25 %	0 %	24376232
7	NC_004349	CCAAAG	2	12	1036	1047	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	24376232
8	NC_004349	GAA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376232
9	NC_004349	TTG	2	6	1131	1136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376232
10	NC_004349	GTTA	2	8	1189	1196	25 %	50 %	25 %	0 %	24376232
11	NC_004349	TGTATT	2	12	1245	1256	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	24376232
12	NC_004349	AG	3	6	1304	1309	50 %	0 %	50 %	0 %	24376232
13	NC_004349	A	6	6	1331	1336	100 %	0 %	0 %	0 %	24376232
14	NC_004349	TGAT	2	8	1434	1441	25 %	50 %	25 %	0 %	24376232
15	NC_004349	GCC	2	6	1463	1468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376232
16	NC_004349	A	6	6	2666	2671	100 %	0 %	0 %	0 %	24376233
17	NC_004349	TAA	2	6	2689	2694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376233
18	NC_004349	AT	3	6	2767	2772	50 %	50 %	0 %	0 %	24376233
19	NC_004349	TCGA	2	8	2777	2784	25 %	25 %	25 %	25 %	24376233
20	NC_004349	GAAA	2	8	2792	2799	75 %	0 %	25 %	0 %	24376233
21	NC_004349	GAT	2	6	2867	2872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376233
22	NC_004349	ATTA	2	8	2907	2914	50 %	50 %	0 %	0 %	24376234
23	NC_004349	ATA	2	6	2921	2926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376234
24	NC_004349	CAA	2	6	2974	2979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376234
25	NC_004349	GAA	2	6	2995	3000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376234
26	NC_004349	CAT	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376234
27	NC_004349	AAC	2	6	3184	3189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376234
28	NC_004349	GAA	2	6	3205	3210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376234
29	NC_004349	TAA	2	6	3233	3238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376234
30	NC_004349	CA	3	6	3264	3269	50 %	0 %	0 %	50 %	24376234
31	NC_004349	A	6	6	3404	3409	100 %	0 %	0 %	0 %	24376234
32	NC_004349	TAC	2	6	3476	3481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376234
33	NC_004349	AGA	2	6	3499	3504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376234
34	NC_004349	AAGA	2	8	3551	3558	75 %	0 %	25 %	0 %	24376234
35	NC_004349	CTT	2	6	3652	3657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376234
36	NC_004349	CAA	2	6	3680	3685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376234
37	NC_004349	GCA	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376234
38	NC_004349	T	6	6	3782	3787	0 %	100 %	0 %	0 %	24376234
39	NC_004349	T	7	7	3849	3855	0 %	100 %	0 %	0 %	24376234
40	NC_004349	TAAA	2	8	3887	3894	75 %	25 %	0 %	0 %	24376234
41	NC_004349	A	7	7	3892	3898	100 %	0 %	0 %	0 %	24376234
42	NC_004349	T	7	7	3921	3927	0 %	100 %	0 %	0 %	24376234
43	NC_004349	ATT	2	6	3933	3938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376234
44	NC_004349	ATC	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376235
45	NC_004349	TTA	2	6	4128	4133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376235
46	NC_004349	TTA	2	6	4143	4148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376235
47	NC_004349	AGA	2	6	4212	4217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376235
48	NC_004349	TCT	2	6	4224	4229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376235
49	NC_004349	T	6	6	4229	4234	0 %	100 %	0 %	0 %	24376235
50	NC_004349	ATTTT	2	10	4329	4338	20 %	80 %	0 %	0 %	24376235
51	NC_004349	AT	3	6	4518	4523	50 %	50 %	0 %	0 %	24376235
52	NC_004349	ATG	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376235
53	NC_004349	TAA	2	6	4582	4587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376235
54	NC_004349	TCA	2	6	4608	4613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376235
55	NC_004349	CAT	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376235
56	NC_004349	TGA	2	6	4766	4771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376235
57	NC_004349	AAG	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376235
58	NC_004349	ACA	2	6	4827	4832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376235
59	NC_004349	TTCATT	2	12	4877	4888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	24376235
60	NC_004349	CAG	2	6	4969	4974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376235
61	NC_004349	AAC	2	6	4980	4985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376235
62	NC_004349	TA	4	8	5011	5018	50 %	50 %	0 %	0 %	24376235
63	NC_004349	GTT	2	6	5064	5069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376235
64	NC_004349	AT	4	8	5147	5154	50 %	50 %	0 %	0 %	24376235
65	NC_004349	TGG	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376235
66	NC_004349	AAT	2	6	5243	5248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376235
67	NC_004349	CA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	0 %	50 %	24376235
68	NC_004349	AAT	2	6	5302	5307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376235
69	NC_004349	AAT	2	6	5311	5316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376235
70	NC_004349	T	7	7	5365	5371	0 %	100 %	0 %	0 %	24376235
71	NC_004349	AG	3	6	5436	5441	50 %	0 %	50 %	0 %	24376235
72	NC_004349	A	6	6	5445	5450	100 %	0 %	0 %	0 %	24376235
73	NC_004349	CTTT	2	8	5499	5506	0 %	75 %	0 %	25 %	24376235
74	NC_004349	T	6	6	5504	5509	0 %	100 %	0 %	0 %	24376235
75	NC_004349	TAT	2	6	5522	5527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376235
76	NC_004349	TATC	2	8	5604	5611	25 %	50 %	0 %	25 %	24376235
77	NC_004349	TCA	2	6	5647	5652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376235
78	NC_004349	CAT	2	6	5722	5727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376236
79	NC_004349	AAC	2	6	5787	5792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376236
80	NC_004349	GGT	2	6	5900	5905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376236
81	NC_004349	CGG	2	6	5913	5918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376236
82	NC_004349	CTT	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118725020
83	NC_004349	GCT	2	6	6097	6102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725020
84	NC_004349	TCG	3	9	6168	6176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725020
85	NC_004349	GTT	2	6	6220	6225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725020
86	NC_004349	TTA	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725020
87	NC_004349	CTTT	2	8	6284	6291	0 %	75 %	0 %	25 %	118725020
88	NC_004349	CTT	2	6	6294	6299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118725020
89	NC_004349	AATGAA	2	12	6332	6343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118725020
90	NC_004349	CCA	2	6	6344	6349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118725020
91	NC_004349	CAT	2	6	6379	6384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118725020
92	NC_004349	TTAGG	2	10	6405	6414	20 %	40 %	40 %	0 %	118725020
93	NC_004349	GCT	2	6	6462	6467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725020
94	NC_004349	TTCAAA	2	12	6646	6657	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118725020
95	NC_004349	ATCA	2	8	6703	6710	50 %	25 %	0 %	25 %	118725020
96	NC_004349	TGG	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118725020
97	NC_004349	TCG	2	6	7180	7185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725021
98	NC_004349	CCG	2	6	7193	7198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118725021
99	NC_004349	A	7	7	7243	7249	100 %	0 %	0 %	0 %	118725021
100	NC_004349	GAA	2	6	7344	7349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118725021
101	NC_004349	TGG	2	6	7413	7418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118725021
102	NC_004349	AGC	2	6	7445	7450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118725021
103	NC_004349	CCG	2	6	7458	7463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118725021
104	NC_004349	GCT	2	6	7535	7540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725021
105	NC_004349	CGCC	2	8	7586	7593	0 %	0 %	25 %	75 %	118725021
106	NC_004349	TTG	2	6	7669	7674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725021
107	NC_004349	CAC	2	6	7684	7689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118725021
108	NC_004349	CTA	2	6	7726	7731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118725021
109	NC_004349	TTG	2	6	7753	7758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725021
110	NC_004349	TGG	2	6	7799	7804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118725021
111	NC_004349	CAGG	2	8	7822	7829	25 %	0 %	50 %	25 %	118725021
112	NC_004349	GCC	2	6	7833	7838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118725021
113	NC_004349	TTA	2	6	7885	7890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376239
114	NC_004349	AC	3	6	7979	7984	50 %	0 %	0 %	50 %	24376239
115	NC_004349	GAA	2	6	8071	8076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376239
116	NC_004349	GTGA	2	8	8122	8129	25 %	25 %	50 %	0 %	24376239
117	NC_004349	GAGC	2	8	8160	8167	25 %	0 %	50 %	25 %	24376239
118	NC_004349	GTA	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376239
119	NC_004349	ATG	2	6	8401	8406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376239
120	NC_004349	ATT	2	6	8476	8481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376239
121	NC_004349	CGA	2	6	8490	8495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376239
122	NC_004349	ATT	2	6	8519	8524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376239
123	NC_004349	ATT	2	6	8600	8605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725022
124	NC_004349	ATGA	2	8	8687	8694	50 %	25 %	25 %	0 %	118725022
125	NC_004349	GAA	2	6	8777	8782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118725022
126	NC_004349	GCA	2	6	8836	8841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376241
127	NC_004349	TGGA	2	8	8904	8911	25 %	25 %	50 %	0 %	24376241
128	NC_004349	GCC	2	6	8932	8937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376241
129	NC_004349	TGC	2	6	8984	8989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376241
130	NC_004349	CAA	2	6	8995	9000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376241
131	NC_004349	TTTG	2	8	9005	9012	0 %	75 %	25 %	0 %	24376241
132	NC_004349	GTT	2	6	9183	9188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376241
133	NC_004349	GCT	2	6	9212	9217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376241
134	NC_004349	ATT	2	6	9276	9281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376241
135	NC_004349	AAACA	2	10	9297	9306	80 %	0 %	0 %	20 %	24376241
136	NC_004349	T	6	6	9484	9489	0 %	100 %	0 %	0 %	24376242
137	NC_004349	AGC	2	6	9500	9505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376242
138	NC_004349	CAC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24376242
139	NC_004349	CAG	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376242
140	NC_004349	GAT	2	6	9554	9559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376242
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143	NC_004349	CAC	2	6	9907	9912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118725044
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171	NC_004349	CAC	3	9	11248	11256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24376243
172	NC_004349	CAA	2	6	11319	11324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376243
173	NC_004349	CA	3	6	11340	11345	50 %	0 %	0 %	50 %	24376244
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266	NC_004349	TTA	2	6	19581	19586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725023
267	NC_004349	TTG	2	6	19654	19659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725023
268	NC_004349	CAA	2	6	19711	19716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118725023
269	NC_004349	AGC	2	6	19776	19781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118725023
270	NC_004349	TTA	2	6	19867	19872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725023
271	NC_004349	CAC	2	6	19949	19954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118725023
272	NC_004349	GTCAC	2	10	19992	20001	20 %	20 %	20 %	40 %	118725023
273	NC_004349	GTC	2	6	20085	20090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725023
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275	NC_004349	CCTT	2	8	20172	20179	0 %	50 %	0 %	50 %	118725023
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280	NC_004349	T	6	6	20426	20431	0 %	100 %	0 %	0 %	118725023
281	NC_004349	TCA	2	6	20486	20491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118725023
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284	NC_004349	T	6	6	20668	20673	0 %	100 %	0 %	0 %	118725023
285	NC_004349	TCA	2	6	20847	20852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376255
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387	NC_004349	CAC	2	6	28772	28777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118725026
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389	NC_004349	GTC	2	6	28908	28913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725026
390	NC_004349	ACGA	2	8	28967	28974	50 %	0 %	25 %	25 %	118725026
391	NC_004349	CCTT	2	8	28995	29002	0 %	50 %	0 %	50 %	118725026
392	NC_004349	TTC	2	6	29010	29015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118725026
393	NC_004349	TGA	2	6	29200	29205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118725026
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